成績概要書 (作成 平成11年1月)
研究課題名: キャピラリーPCR法による牛胚性判別所要時間の短縮 (キャピラリーPCRによる牛胚性判別実用技術の確立) 予算区分: 道費 担当科:新得畜試 生産技術部 生物工学科 研究期間:平7−9年度 協力・分担関係: なし |
1.目 的
PCR法を用いた牛胚の性判別技術を実用化し普及させるにあたって,改善が求められているPCR所要時間の短縮について、最近開発されたキャピラリーPCR装置を用いた条件について検討し、併せて判別胚の移植試験を行う。2.方 法
1)キャピラリーPCR法の検討3.結果の概要
1)キャピラリーPCR装置を用いて,これまでと同じ条件でPCRを行った場合,既存の装置に比べて温度の上昇下降速度が速いため,PCR所要時間は約30分短縮された。 表1.PCR反応条件(従来法)
サンプル | 10μl | |
PCR反応液 | 40μl | |
反応緩衝液(10倍) | 5.0μl | |
dNTPs | 200μM | |
耐熱性DNA ポリメラーゼ |
1.0 U | |
プライマー | 各15pmol | |
マグネシウム | 1.5 mM | |
計 | 50μl | |
PCR プログラム |
1サイクルの 設定温度と時間 |
各サイクルの 反復回数 |
95℃(3分) | 1回 | |
95℃ - 52℃ - 72℃ | 45回 | |
(30秒) (45秒) (45秒) | ||
72℃(5分) | 1回 | |
PCR所要時間 | 3時間 |
表2.キャピラリーPCR法の反応条件
サンプル | 5μl | |
PCR反応液 | 15μl | |
反応緩衝液(10倍) | 2.0μl | |
dNTPs | 200μM | |
耐熱性DNA ポリメラーゼ |
1.0 U | |
プライマー | 各15pmol | |
マグネシウム | 3.0 mM | |
計 | 20μl | |
PCR プログラム |
1サイクルの 設定温度と時間 |
各サイクルの 反復回数 |
95℃(3分) | 1回 | |
95℃ - 52℃ - 72℃ | 5回 | |
(15秒) (30秒) (20秒) | ||
95℃ - 52℃ - 72℃ | 40回 | |
(10秒) (15秒) (5秒) | ||
PCR所要時間 | 3時間 |
表3.PCR方式による判別率の比較成績
PCR方式 | 供試胚数 | 判別できた胚数 | 判別率 |
キャピラリー法 従来法 |
223 223 |
175(♂111,♀64) 199(♂122,♀77) |
78.5% 89.2% |
表4.キャピラリーPCR法による性判別移植成績
供試胚数 | 判別結果 | 判別率(%) | 移植頭数1) | 受胎頭数(%) | 分娩頭数 | 判定一致率 |
38 | 29 | 76.3 | 14 | 8(57.1) | 8 | 100% |
|
♂ 17 ♀ 12 判別不可 9 |
6 4 4 |
4 1 3 |
♂4 ♀1 ♂2,♀1 |
4.成果の活用面と留意点
1)判別率の低下を考慮しても、時間短縮が優先する場合は有効な方法である。
2)現状では性判別胚の凍結法については未確立なので、当面は新鮮胚移植と組み合わせての利用となる。
5.残された問題とその対応
1)キヤピラリーPCR法の判別率向上