栽培漁業の対象種としてニシンとヒラメを研究対象にしています。
沿岸の漁業種としてエゾバフンウニ、キタムラサキウニの生態、モニタリング調査を実施しています。
また、ウニ類の餌として日本海沿岸で重要視されているホソメコンブを研究の対象にしています。

磯焼け漁場の機能回復技術に関する試験研究と、コンブなど海藻類の繁茂量やウニ類の発生量の年毎の変化について長期観察を実施しています。

ヒラメ、ニシンなど魚類資源の栽培漁業技術開発に関する試験研究を行っています。
ヒラメは平成8年から日本海で毎年220万尾の放流事業が行われています。
ニシンは平成8年から日本海で放流が開始され、平成15年以降は毎年約200万尾が放流されています。