河畔林の役割がよくわかりましたが、針葉樹（特にカラマツ）の役割はありますか？

残念ながら針葉樹の果たす役割についてはよくわかっていません。北海道では、河畔林を構成する樹種はほとんどが落葉広葉樹のため、針葉樹の葉っぱばかりが川に落ちるということが実態としてもあまり観察されないためです（全くないわけではありませんが、量として非常に少ないです）。

北米等ではヒグマが森林に搬入する鮭の成分が土から検出されているとい聞いたことがありますが、道内でも同様なことが確認されていますか？また、どの地域、河川で顕著ですか？

まず、ご指摘の北米での研究例ですが、土ではなく、河畔の植物（樹木や草）の葉っぱを分析したという報告と思います。土を分析した報告もあるにはありますが、葉っぱほど顕著に結果が出ていません。
また、正確には、サケの成分を検出しているわけではなく、「安定同位体窒素（通常の窒素より質量が重い窒素）」の含まれる割合（安定同位対比）を分析しています。これは安定同位体窒素が、淡水や陸上の生物よりも海の生物に含まれる割合が多いことを利用しているもので、安定同位体窒素の含まれる割合が多ければ、海由来の窒素を多く含むと判断できるため、サケの栄養が陸上に運搬されているかどうかを判断する指標として用いられています。
河畔の植物の葉っぱについて、北海道内で窒素の安定同位体比を分析した例では、北米の研究例と同様、サケ遡上量の多い川で安定同位対比が高くなる、すなわち河畔植物がサケ由来の窒素を吸収していることがわかっており、流路1kmあたり1000尾を超えるとその傾向が顕著に見られるようになります。

ホッチャレの河川に残積するものと、海に流されてしまうものとの割合は、どのくらいですか？

川の規模（水量の多寡）、またホッチャレが川の上・中・下流どこにあるかで、流されてしまうホッチャレの割合は大きく変わってくると思いますが、調査事例が少なく一般的な法則はわかっていません。
予想としては、水量が多く、河口に近いほど、海に流される割合は多く、上流にまで遡上できたサケほど（水量も少なく、ホッチャレが引っかかる場所も多いため）流出する割合が少ないと考えられます。

森林から落ち葉等の栄養が河川に流入し、その後、海中の海草類の生育に役立つことは知っていますが、同じように鮭が上る川が流入する海域では流下したホッチャレによる海草への栄養供給等は確認されていますか？

とても興味深い話だとは思いますが、まだ確認はされていません。

ホッチャレはオス、メスともに栄養分は同じですか？

当方では、サケの栄養成分について直接分析しておらず、知見は持っておりません。最新の食品成分表では、サケの種類別（シロサケ、アトランティックサーモンなどの区別をしている）に成分を掲載しているようですので、ご覧になってみたらよいと思います。ただし、オスメスの別については記載はないようです。

熊や狐・狸が食べるホッチャレは部位により食べられる量が違うのですか？また、生きている鮭をつかまえて食べる場合とホッチャレを食べる場合では違いがありますか？
また、ホッチャレとして食べられる鮭、生きているときに捕まえられて食べられる鮭、食べられることなくホッチャレとして分解されていく鮭の割合はどんなものですか？

当方の調査では、動物の行動を直接観察しているわけではないので、残念ですが確実なことはお答えできません。
限定的な情報であることを前提に、これまで調査した２、３カ所の川の状況を申しますと、（川に来た生き物にとって）そこに十分な量のホッチャレがある場合、ほ乳類は体の一部しか食べずに放置することがほとんどです。食べられる部位としてもっとも多く見られるのは頭部（氷頭）です。卵や白子なども食べそうですが、食べられているのを実際に目にしたことは殆どありません。また、冬眠しないキタキツネやエゾタヌキは、厳冬期、雪の下に埋もれたホッチャレを掘り出して食べています。この時期には、全部きれいに食べているようです。
ちなみに、鳥類の場合、目玉、卵など柔らかいところを先に食べるようです。ほ乳類に比べると、一部だけ食べるというのではなく、きれいに平らげてしまうという印象があります。
新鮮なサケを食べるか、ホッチャレを食べるかについて、その割合は不明ですが、両方食べられているのを確認しています。鳥類についても、カモメ以外は、腐肉でも構わないようです。面白い例として、カワガラスが潜水してサケの卵を食べていることが観察されています。
ホッチャレを利用する生物の種類や、いつの時期に多く食べられるのか、また食べられる割合は、サケの遡上時期、川の地形、大きさ、遡上量、周辺の土地利用状況（動物にとって川にアクセスしやすいかどうか）などによって変わってくると考えられます。北海道内では、サケの遡上時期は9月下旬から12月下旬までと多岐にわたり、また遡上量には年変動もあります。したがって、北海道を一括りにはできず、かなり地域性があるのではないかと予想しています。これまでの調査結果や経験を元に、今後、ビデオ観察や自動撮影カメラ等を用いた調査を全道様々なサケ遡上河川で実施してみたいと考えています。

鮭の上らない河川、上がらなくなった河川と上がる河川とでは海域、森林の栄養状態はかなり違うものですか？

当方も大変興味深いテーマと捉えております。現時点で試算しようと思うと乱暴な計算になってしまう危険性がありますが、道内での調査事例を増やす、あるいは広域調査するなど、データ蓄積が進めば、将来、推定できるようになると思います。

陸上に運ばれるホッチャレの調査を行ったどの川ですか。

この調査河川では、サケ遡上期間中、ヒグマが川に来ています。対処などの予備知識があればよいのですが、ない場合、大変危険なので、Web上で河川名を公表することは差し控えさせていただきます。