明治４２年(１９０９)北海道庁立渡島農事試験場として開設され、その後北海道立道南農業試験場の名称に改称されました。平成２２年（２０１０）には独法化し、地方独立行政法人北海道立総合研究機構道南農業試験場となりました。　　　　　　　　　　　　主に、道南地域（渡島総合振興局・檜山振興局）における園芸、稲作、畑作の試験研究に取り組んでおり、水稲の世代促進と施設利用野菜の品質向上、低コスト化、省力化ための技術開発、さらに､安全性や環境保全に配慮した病害虫防除、施肥･土壌管理などの技術開発を進めています。また、地域農業振興のため、大豆などの畑作物に関する技術開発及びそれに基づく支援に取り組んでいます。

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