• 函館水産試験場
  • 場長
• 総務部
  • 総務部長
  • 総務課長（兼）
  • 主査（総務）
  • 主査（調整）
• 調査研究部
  • 調査研究部長
  • 研究主幹
  • 主任主査（資源管理）
  • 主任主査（沿岸環境）
  • 主任主査（沿岸資源）
  • 主任主査（資源増殖）
  • 主査（栽培技術）
• 試験調査船　金星丸 
  • 船長
  • 機関長
  • 航海長
  • 通信長

（職員数：31名）
研究職：11名
海事職：16名
　行政職：4名