北海道の道東地域（網走・根室・釧路・十勝管内）を担当エリアとし、さけ・ますの増殖や資源の管理とそれに関わる種々の調査研究を行っています。 

各担当地域において、民間ふ化場への技術支援、増殖事業の進行状況の把握、さけ・ますの年齢査定（斜里川・網走川・常呂川・湧別川・標津川・当幌川・西別川・釧路川・十勝川・広尾川）、放流計画策定の支援、種卵需給調整の支援等に取組んでいます。

調査研究では、社団法人根室管内さけ・ます増殖事業協会の受託事業として「根室南部サケ回帰率向上試験」を本場・北海道大学・さけますセンター・北海道区水産研究所からなるプロジェクト体制で調査を行っています。また、平成23年度から「根室海区におけるカラフトマスの回帰特性」と「サケ自然再生産資源の評価に関する研究」が始まり、カラフトマス資源の造成・管理と野生サケの実態解明をめざします。