釧路水産試験場は、根室・釧路・十勝海域を担当エリアとし、その主要課題として、サンマやケガニ、シシャモなどの資源管理に関する調査研究、アカボヤやアサリ、マツカワの増殖や放流技術開発に関する調査研究などに取り組んでいます。
また、水産加工利用における調査研究・指導は、根室～日高管内（根室・釧路・十勝・日高）を担当エリアとしています。