温根沼（オンネトウ）は、風蓮湖のすぐ東にある、根室半島のつけねに位置し、根室半島の根元をほとんど横断している湖沼である。温根沼は、入り江の出口が砂州によって閉ざされて形成された海跡湖である。

温根沼は、湖面標高0 m、最大水深7.3 m、湖面積6.44 km²、集水域面積53.05 km²の浅い汽水湖である。

流入河川は、南側より、オンネベツ川が流入している。流出水は、北側で、幅500 mの水路を経て根室湾に注いでいる。

集水域の土地利用は、ほとんどが山林や湿地などの自然地である。湖の北側奥や、流出口付近の湖岸は、一部湿地環境を呈している。

表層の塩化物イオン濃度は高く、海水が80％くらい混合している程度の塩分環境であった。

TNおよびTP濃度に関して、1991年はリン濃度が高く、温根沼は窒素濃度は富栄養湖レベル、リン濃度は過栄養湖レベルであった。